Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPED1A4D0V7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPED1A4D0V7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CPED1A4D0V7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms