Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E2F8A0AVK6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E2F8A0AVK6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
E2F8A0AVK6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E2F8A0AVK6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
E2F8A0AVK6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms