Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
U3KQ87 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
U3KQ87 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
U3KQ87 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms