Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms