Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF3C3Q9Y5Q9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms