Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMED7Q9Y3B3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms