Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LEMD3Q9Y2U8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LEMD3Q9Y2U8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms