Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SBNO2Q9Y2G9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms