Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ICE1Q9Y2F5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms