Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
APOBEC2Q9Y235 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC2Q9Y235 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms