Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHOC2Q9UQ13 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms