Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms