Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNRF3Q9ULT6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms