Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms