Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENND2AQ9ULE3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENND2AQ9ULE3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms