Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRPF3Q9ULD4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF3Q9ULD4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms