Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PADI1Q9ULC6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms