Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS11EQ9UL52 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMPRSS11EQ9UL52 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms