Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMFRQ9UKV5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms