Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms