Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA1Q9UJY5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms