Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPUSD1Q9UJJ7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms