Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms