Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VTI1BQ9UEU0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms