Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
REREQ9P2R6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
REREQ9P2R6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms