Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMD4AQ9P2Q2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMD4AQ9P2Q2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMD4AQ9P2Q2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMD4AQ9P2Q2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FRMD4AQ9P2Q2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FRMD4AQ9P2Q2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms