Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP35Q9P2H5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP35Q9P2H5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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