Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms