Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms