Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM53CQ9NYF3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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FAM53CQ9NYF3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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FAM53CQ9NYF3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FAM53CQ9NYF3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FAM53CQ9NYF3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FAM53CQ9NYF3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FAM53CQ9NYF3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM53CQ9NYF3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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FAM53CQ9NYF3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM53CQ9NYF3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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