Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VNN3Q9NY84 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms