Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PGPEP1Q9NXJ5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms