Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR3EQ9NVU0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR3EQ9NVU0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms