Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms