Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM106BQ9NUM4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms