Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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