Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUOX1Q9NRD9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUOX1Q9NRD9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms