Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAB9BQ9NP90 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB9BQ9NP90 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms