Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LIN28AQ9H9Z2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms