Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms