Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms