Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms