Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SHARPINQ9H0F6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms