Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC90BQ9GZT6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms