Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MTMR12Q9C0I1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR12Q9C0I1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms