Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP74Q9C0B2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP74Q9C0B2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms