Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM3Q9BZL3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM3Q9BZL3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms