Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIOK2Q9BVS4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms