Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RTKNQ9BST9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms