Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM79Q9BSE2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms